سید موسی صدر در سال 1307 ش (1343 ق) در شهر قم به دنیا آمد.
وی از محضر آیات عظام سیدصدرالدین صدر (پدرش)، سید محمد محقق داماد، سید حسین بروجردی و امام خمینی(ره) کسب فیض نمود.
سپس عازم نجف شد و از درس فقیهان آن دیار نیز بهره‌مند گردید.
وی پس از وفات آیت‌اللَّه سیدعبدالحسین شرف‌الدین، رهبری شیعیان لبنان را به عهده گرفت و آنان را از وضعیت ناهنجار فرهنگی، اجتماعی و سیاسی رهایی بخشید و در برابر دسیسه‌های دشمنان اسلام، آنان را در تشکیلات "حرکت المحرومین" متشکل ساخت.
این مجاهد نستوه و خستگی‌ناپذیر با هدف ایجاد اتحاد بین اعراب و جلب حمایت کشورهای عربی و متقاعد ساختن آنان به منزوی کردن اسراییلِ متجاوز و تحریم هرگونه رابطه با اشغالگران فلسطین و به منظور تقویت جنبش محرومین و تهیه سلاح، به کشورهای مختلف سفر می‌کرد.
امام موسی صدر، در پی دعوت رسمی دولت لیبی، به این کشور سفر نمود، لیکن براثر توطئه‌ای در همان سفر ناپدید شد.
گرچه اخبار ضد و نقیضی درباره زندانی بودن وی منتشر می‌شود، با این حال هنوز اطلاعات موثّقی از وی به دست نیامده است.